Tridsaťštyriročný krajný obranca reprezentoval Španielsko v 22 medzištátnych zápasoch, na EURO 2012 bol členom majstrovského kádra La Furie Roja. S Atleticom získal počas osem a pol ročného pôsobenia viacero významných trofejí. V roku 2013 triumfovalo Atletico v španielskom Kráľovskom pohári, o rok neskôr vyhralo La Ligu, dvakrát sa radovalo z víťazstva v Európskej lige UEFA (2012, 2018) a dvakrát získalo európsky Superpohár (2012, 2018). V rokoch 2014 a 2016 neuspelo vo finále Ligy majstrov. Juanfran sa v Sao Paule stretne s brazílskym veteránom Danim Alvesom, ktorý v lete odišiel z Paríža SG.