Isanova zatkli v roku 2005 a pôvodne ho obvinili za plánovanie zvrhnutia vlády. Toto obvinenie voči nemu neskôr stiahli a v roku 2007 ho uznali vinným z nelegálnej privatizácie štátneho majetku. Pred dvomi rokmi ho dodatočne odsúdili za prechovávanie psychotropných látok vo väzení a za potýčku so zamestnancom väzenia. Isanov tvrdí, že obvinenia voči nemu sú zmanipulované, aby ho udržali vo väzbe. Ľudskoprávne skupiny ho považujú za politického väzňa.