Pod jeho vedením Zlín osemkrát prehral a po základnej časti najvyššej českej súťaže Fortuna ligy 2018/2019 skončil až na 9. mieste. Tím dočasne povedú asistenti Jan Kameník, David Hubáček a Otakar Novák. Informoval o tom FC Fastav Zlín na svojej oficiálnej webovej stránke.
Pivarník v januári podpísal s českým klubom zmluvu na 2,5 roka, ktorú však nenaplní. V minulosti viedol aj Tatran Prešov, Viktoriu Plzeň či pražský tím Bohemians 1905.