Správna rada ÚPN zabezpečuje činnosť ústavu pri plnení úloh podľa zákona o pamäti národa. Má deviatich členov. Piatich členov na návrh určeného výboru volí Národná rada Slovenskej republiky, po dvoch vymenúvajú vláda SR a prezident SR. Správna rada zo svojich členov volí predsedu a jedného podpredsedu.