McGahn zohral dôležitú rolu pri Trumpových personálnych zmenách vo federálnom súdnictve, pri prezidentovom výbere sudcu najvyššieho súdu Neila Gorsucha aj pri nominácii spomínaného Kavanaugha. Jeho pôsobenie však vlani poznačil nepokoj okolo špeciálneho prokurátora Roberta Muellera, ktorý vyšetruje údajné zasahovanie Ruska do prezidentských volieb. Prezident chcel Muellera prepustiť, no McGahn mu pohrozil vlastnou výpoveďou, ak sa o to bude ďalej pokúšať.