Činnosť centra, ktoré sídli v nemeckom meste Bad Arolsen, sprevádzali v minulosti kontroverzie spojené s obvineniami, že dokumenty odmieta sprístupniť verejnosti. Centrum pritom na svoju obhajobu až do roku 2008 uvádzalo, že sa v tejto veci len riadi nemeckými zákonmi, ktoré v rámci ochrany súkromia umožňujú sprístupniť verejnosti archívne informácie o konkrétnych osobách až sto rokov po ich smrti.