Vznik fakulty bol podmienený akreditovaním študijných programov na II. stupni štúdia. Druhý stupeň vysokoškolského vzdelávania bol podľa Štefánkovej splnený v študijnom programe Fyzioterapia, ktorý bol akreditovaný v roku 2017. Výučba sa začala v akademickom roku 2017/2018 a v júni 2019 ukončili magisterské štúdium prví absolventi.
„Inštitút fyzioterapie, balneológie a liečebnej rehabilitácie UCM v Trnave sa uchádza aj o tretí stupeň vysokoškolského vzdelávania, na čo má dobré predpoklady. Je vysoko pravdepodobné, že v dohľadnej dobe získa príslušnú akreditáciu, pretože má dostatočne kvalifikovaný pedagogický zbor, ktorý sa v poslednom roku výrazne posilnil špičkovými pracovníkmi,“ povedal rektor Univerzity sv. Cyrila a Metoda Roman Boča.
V súčasnosti študuje v akreditovaných študijných programoch Inštitútu fyzioterapie, balneológie a liečebnej rehabilitácie 762 študentov. Jeho študijné programy patria v sústave študijných odborov medzi nelekárske zdravotnícke vedy. Inštitút pôsobí v Piešťanoch, tam by mala sídliť aj Fakulta zdravotníckych vied UCM. V bakalárskom stupni štúdia má akreditovaný aj druhý študijný odbor Rádiologická technika.
Univerzita sv. Cyrila a Metoda v Trnave vznikla v roku 1997, momentálne poskytuje vzdelávanie na filozofickej fakulte, fakulte masmediálnej komunikácie, fakulte prírodných vied, fakulta sociálnych vied a v Inštitúte fyzioterapie, balneológie a liečebnej rehabilitácie.